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项目作者： avilab

项目描述 ：
CD-HIT suite singularity image
高级语言：
项目地址: git://github.com/avilab/singularity-cdhit.git
创建时间： 2020-01-10T13:40:05Z
项目社区：https://github.com/avilab/singularity-cdhit
开源协议：MIT License
下载


https://www.singularity-hub.org/static/img/hosted-singularity--hub-%23e32929.svg

CD-HIT singularity image

Download container

  1. singularity pull --name avocado_container.sif shub://avilab/singularity-cdhit

Run CD-HIT

  1. singularity exec avocado_container.sif psi-cd-hit.pl -i contigs.fa -o clustered-contigs.fa -c 0.9 -G 1 -g 1 -prog megablast